La France signale le premier décès humain lié au virus Shamonda, un agent pathogène du bétail

Un patient traité aux Hospices Civils de Lyon, dans l'est de la France, est décédé au début d'octobre 2026 après avoir contracté le virus Shamonda (SHAV), ont déclaré les ministères français de la Santé et de l'Agriculture. C'est la première fois que le virus a été documenté chez un humain, après des décennies de circulation parmi le bétail en Afrique et en Asie.

Le patient était gravement immunodéprimé et était déjà traité pour une maladie sous-jacente grave, selon les autorités françaises. Des rapports citant les autorités françaises ont indiqué que l'infection a été suivie de complications cérébrales, bien qu'il n'ait pas été confirmé si le virus Shamonda a causé ou contribué au décès.

Qu'est-ce que le virus Shamonda

Le virus Shamonda a été isolé pour la première fois dans le bétail au Nigéria en 1965 et a depuis été détecté dans certaines parties de l'Afrique et de l'Asie, selon l'Organisation mondiale de la santé animale (WOAH). Il appartient au groupe sérologique Simbu des orthobounyavirus, la même famille que le virus Schmallenberg, qui a émergé en Allemagne en 2011.

Le virus se propage principalement par les piqûres de moucherons Culicoides et affecte principalement le bétail bovin, bien qu'il ait également été trouvé chez les moutons, les chèvres, les chevaux et les alpagas, selon la WOAH. Les animaux infectés peuvent présenter de la fièvre, de la diarrhée et une réduction de la production laitière ; certains cas européens ont également impliqué des avortements et des malformations fœtales chez les animaux gestants. Une étude menée sur une ferme laitière française citée par Irish Times a révélé que la production laitière a baissé jusqu'à 75 % dans les troupeaux affectés. Aucun vaccin commercial n'existe actuellement.

Comment le virus a atteint l'Europe

Le virus Shamonda a été détecté chez le bétail européen pour la première fois en 2026, avec des signes cliniques chez le bétail signalés à partir de juin et une confirmation en laboratoire en fin juillet. Il a depuis été identifié chez les animaux dans au moins une douzaine de pays européens et de territoires, notamment l'Autriche, la Belgique, la France, l'Allemagne, l'Irlande, l'Italie, le Liechtenstein, le Luxembourg, les Pays-Bas, le Portugal, la Slovénie, l'Espagne et Jersey. Les chercheurs ont identifié deux variantes circulantes en Europe, désignées SHAV-EU1 et SHAV-EU2.

Comment le patient aurait pu être infecté

Les autorités françaises ont déclaré que l'hypothèse de travail est que le patient a été infecté par une piqûre de moucheron Culicoides dans l'est de la France, une région où le virus a été détecté chez les animaux au printemps et en été 2026. L'espèce exacte de moucheron impliquée n'a pas été identifiée, et les enquêteurs tentent toujours de confirmer comment la transmission à un humain s'est produite.

Réponse officielle et évaluation des risques

Les ministères français de la Santé et de l'Agriculture ont décrit le cas comme exceptionnel, notant qu'il s'est produit chez un patient gravement immunodéprimé. Ils ont ajouté que malgré des décennies de circulation du virus Shamonda en Afrique et en Asie, aucun cas humain n'avait été documenté jusqu'à présent.

L'ECDC a déclaré qu'il coordonne avec les autorités françaises et les partenaires européens pour évaluer les implications potentielles pour la santé publique, et a confirmé que les enquêtes sont en cours pour déterminer si le virus a causé ou contribué au décès du patient et comment l'infection a été acquise. L'Organisation mondiale de la santé a également été informée, selon les autorités françaises.

Ce qui reste inconnu

• Si le virus Shamonda a directement causé la mort du patient ou a été un facteur contributif aux côtés de l'immunodéficience préexistante.
• L'espèce exacte de moucheron responsable et les circonstances précises de la transmission.
• Si d'autres infections humaines non détectées se sont produites, en particulier chez les personnes immunodéprimées dans les régions affectées.
• Si le déclin saisonnier de l'activité des moucherons à mesure que les températures baissent réduira le risque de transmission supplémentaire, comme certaines autorités sanitaires l'ont suggéré.

Les autorités ont souligné que le cas semble jusqu'à présent isolé et lié au système immunitaire compromis du patient, et qu'aucune infection humaine supplémentaire n'a été signalée.